Protistejä ja sieniä

esittely

Protistejä ja sieniä ovat kaksi ainutlaatuista elämän valtakuntaa. Protisteillä on voimakas varianssi niiden ominaisuuksista, jotka vaikeuttavat niiden luokittelua. Sienet ovat paljon yksinkertaisempaa luonnehtia. Sienet eroavat protisteista noin 1,5 miljardia vuotta sitten [1] tapahtumasta, joka aiheutti flagellum-tappion siirtymisen aikana vedestä maanpäälliseen elinympäristöön ja uusien ei-vesieliöiden perustuvien spore-hajotusmekanismien kanssa samanaikaisesti kehittämällä [2]. Sienet ovat sopeutuneet tunnistettaviin ominaisuuksiin, jotka auttavat selkiyttämän eroja protisteistään.

Cellular Differences

Protistit ovat yksisoluisia organismeja. Suurin osa sienistä on monisoluisia ja jäsenneltyjä haaroittuvassa pitkänomaisessa ristihäiriösysteemissä [1]. Haaroittuvat hyphae-rakenteet koostuvat yhdestä tai useammasta solusta, jotka on suljettu putkimainen soluseinään [1]. Useimmat protisteistä ovat muodoltaan pallomaisia, jotka eivät ole optimaalisia hapen saamiseksi diffuusiolla. Suurilla protisteillä on pitkänomainen muoto, jotta ne pystyvät vastaamaan lisääntyneeseen tarpeeseensa hapen diffuusiolle [3].

Solun koko

Yksisoluisia protisteja on enimmäkseen mikroskooppisia, mutta harvinaisia ​​esimerkkejä on löydetty tuhansista neliömetreistä alueella [3]. Sienet ovat yleensä riittävän suuria, jotta ne voidaan havaita paljaalla silmällä, mutta suuri määrä mikroskooppisia lajeja on olemassa [1].

Solukalvo

Protisteillä voi olla kasveja muistuttavia soluseinämiä, eläinmuotoisia soluseiniä ja jopa kalvoja, jotka suojaavat ulkoiselta ympäristöltä [3]. Monilla protisteillä ei ole soluseinää [3]. Toisin kuin Protist-solukalvon lajike, sienten määrittelyominaisuus on kitinisen soluseinän [14].

Solunsisäinen organisaatio

Sienet koostuvat höyryjen sekajärjestelmästä, joka on osastoitu septa-jakaumajärjestelmän avulla [1]. Septaa ei ole löydetty mihinkään protisteihin [3]. Sienten septa jakaa hyphaea läpäiseviin osastoihin [1]. Sepnan rei'itys mahdollistaa organelaalien translokaation, mukaan lukien ribosomit, mitokondriot ja ytimet solujen välillä [3]. Protistejä organeleja esiintyy ei-osastoidussa sytoplasmassa [3].

Solulaariset liitteet

Toisin kuin useimmiten paikallaan olevat sienet, protistit ovat liikkuvia [1,3], ja tämä motility erottaa protistejä morfologisesti sienten avulla lisäämällä solujen appendageja. Protisteillä on usein appleja, kuten silavaa, flagellaa ja pseudopodiaa [3]. Sienillä ei yleensä ole solujen appendageja, vaikka harvinaisia ​​esimerkkejä konidial-appendageista sieniä esiintyy [4].

hengitys

Protistihengitys

i) Protist-aerobinen hengitys

Protisteillä saadaan happea diffuusiolla ja tämä rajoittaa niiden kapasiteettia solukasvulle [3]. Jotkut protisteista, kuten fytoflagellateista, tekevät sekä autotrofista että hapettavaa heterotrooppista aineenvaihduntaa [3]. Protisti-aineenvaihdunta toimii optimaalisesti laajalla lämpötila-alueella ja hapen kulutusmäärillä. Tämä on sivutuote lukuisista niipeistä, joita he asuvat, ja niillä on laaja valikoima lämpötiloja ja hapen saatavuutta [3].

ii) Protista anaerobinen hengitys

Pakollinen anaerobinen hengitys on loistavien protisteiden joukossa, harvinaisuus eukaryootteille [3]. Monet velvoittavat anaerobitavat Protisteillä ei ole sytokromioksidaasia, joka johtaa epätyypillisiin mitokondrioihin [3].

iii) sienen hengitys

Useimmat sienet hengittävät aerobisesti käyttämällä haarautuneita hengitysketjuja elektronien siirtämiseksi NADH: sta happeeksi [5]. Sieni-NADH-dehydrogenaaseja käytetään katalysoimaan matriisin NADH: n hapettumista ja kykenevät tekemään niin myös joidenkin estäjien kuten rotenonin läsnä ollessa [5]. Sienet käyttävät myös vaihtoehtoisia oksidaseja hengittämään ubiquinolin inhibiittoreiden läsnä ollessa: sytokromi c oksidoreduktaasi ja sytokromi-oksidaasi [5]. Vaihtoehtoiset oksidaasit todennäköisesti mahdollistavat tehokkaan patogeenisyyden typpioksidipohjaisten isäntäpuolen puolustusmekanismien läsnä ollessa [5].

osmoregulation

Vesiympäristössä asuvilla protisteilla on monistuminen solurakenteista, joita ei löydy sienistä. Tämä vahvistus mahdollistaa suuremman osmoregulaation asteen. Sopimattomat tyhjöt ovat protistejä organeleja, jotka mahdollistavat osmoregulaation ja estävät turvotuksen ja solun repeämisen [3].Sopimattuja tyhjiöitä ympäröi putki- ja vesikkelijärjestelmä, jota kutsuvat kollektiivisesti spongiomiksi, joka auttaa kaventamaan supistuvien tyhjiöiden solusta [3]. Sileät tyhjiöt ovat huomattavasti vähemmän runsaasti sieniä [1,3].

Mitokondrioerot

Protist mitokondrioiden genomit

Toisin kuin sienet, protisti mitokondrio (mt) -genomit ovat säilyttäneet lukuisia ancestral proto-mitokondrioita genomisia elementtejä. Tämä on ilmeistä geenien vähentämisellä sienten mtGenomeilla [6]. Protist mtGenomit vaihtelevat kooltaan 6 kb: n genomista Plasmodium falciparum 77: n generaalille choanoflagellate Monosiga brevicollis, pienempi alue kuin sienten [6]. Keskimääräinen Protist mtGenome-koko on 40 kB merkittävästi pienempi kuin keskimääräinen sienimen mitokondrioiden genomin koko [6].

Protist-mtGenomit ovat pienikokoisia, eksonipitoisia ja usein koostuvat päällekkäisistä koodausalueista [6]. Ei-koodaava intronic-tila on alle 10% koko Protist mtGenomen koosta [6]. Suuri osa Protist-mtDNA: sta ei ole ryhmää I tai II-intronia [6]. A + T-pitoisuus on korkeampi Protist mtGenomeissa verrattuna sieniin [6]. Protist mtGenomien geenipitoisuus muistuttaa kasvien mtGenomeja enemmän kuin sienten mtGenomes [6]. Toisin kuin sienten, Protist mtGenomit koodaavat sekä suurille että pienille alayksiköiden RNA: ille [6].

Sieni-mitokondrioiden genomit

Sienet kehittyivät protisteistä ja niiden eroista on ominaista geenin vähentäminen ja intronin lisäys [6]. Verrattuna geenisiin rikkaisiin Protist mtGenomeihin, sieni-mtGenomit sisältävät runsaasti intergeenisiä alueita, jotka koostuvat ei-koodaavista toistoista ja introneista, jotka ovat enimmäkseen I-ryhmän introneja [7]. Sienin mtGenome-koon vaihtelu selittyy lähinnä intronialueilla eikä geenipohjaisella varianssilla, joka löytyy Protist mtGenomeista [7]. Siirtogeeniset alueet edustavat jopa 5 kb pituutta sieni-mtGenomeissa [7].

Vaikka Protist-mtGenomit sisältävät enemmän geenejä, sieni-mtGenomit sisältävät huomattavasti suuremman määrän tRNA: ta koodaavista geeneistä [6,7]. Sienten mtGenome-koot ulottuvat suuremmalle alueelle kuin Protist mtGenomes. Pienin tunnettu sienen mtGenome on 19 kbp Schizosaccharomyces pombe [6]. Suurin tunnettu sienen mtGenome on 100 kbp Podospora anserina [6]. Toisin kuin Protist mtGenomes, geenin mtDNA: n geenipitoisuus on suhteellisen yhdenmukainen eri organismeissa [6].

Ravintoaineiden lähteet ja ravintoaineiden hankintastrategiat

Sienten ravintoaineiden hankinta

Sienet käyttävät myseeliä, niiden hyphae-kokoelmia, hankkimaan ja kuljettamaan ravinteita solujensa plasmamembraanin läpi [2]. Tämä prosessi on erittäin riippuvainen sen ympäristön pH: sta, josta ravinteet on saatu [2]. Sienet ovat saprotrofeja, jotka hankkivat ravinteita pääasiassa hajoavien kuolleiden kasvien ja eläinten liuenneesta orgaanisesta aineesta [1]. Tarvittavat ravintoaineiden ruoansulatus tapahtuu ekstrasellulaarisesti vapauttamalla entsyymit, jotka hajottavat ravintoaineet monomeereiksi, jotka joutuvat helpottamaan diffuusiota [1]

Protist Nutrient Acquisition

Sitä vastoin vastustajat saavat ravintoaineensa erilaisilla strategioilla. Yritetään luokitella Protista ravintoaineiden hankintastrategiat määritellään kuuteen luokkaan [3]:

1. Kuva-autotrooppiset alkutuottajat - Käytä auringonvaloa hiilidioksidin ja H2O: n ravintoaineiden syntetisoimiseen.
2. Bacti- & detritivores - Syöte bakteereihin tai detritukseen.
3. Saprotrophs - Syöri ekstrasellulaarisesti hajotettuihin ja myöhemmin imeytyneisiin ei-elävään aineeseen.
4. Algivores - Syö ensisijaisesti levät.
5. Epäselektiiviset Omniivores - Syöte ei-selektiivisesti leville, detrituksille ja bakteereille.
6. Raptorial Predators - Syö ensisijaisesti alkueläimiä ja organismeja korkeammista troofitasoista.

Monet edellä mainituista strategioista ovat mixotrofisia. Esimerkiksi fotoautrofisten alkutuottajien joukossa on meren pohjaisia ​​organismeja, jotka voivat käyttää eri heterotrofian tasoja, mikä mahdollistaa ravintoaineiden hankinnan, joka ei vaadi auringonvalolta energiaa, kun auringonvalo ei ole käytettävissä [3].

Lisääntymiseroja

Protisteihin ja sieniin kuuluvat molemmat lajit, jotka lisääntyvät seksuaalisesti ja aiseksisesti. Protisteetit ovat ainutlaatuisia, koska ne sisältävät sellaisia ​​organismeja, jotka pystyvät sekä aiseksuaaliin että seksuaaliseen lisääntymiseen samassa elämässä [8]. Joidenkin protisteiden elinkaaren monimutkaisuus johtaa tainnuttaviin morfologisiin vaihteluihin elimistön elinaikana, mikä mahdollistaa erilaiset lisääntymismenetelmät [8]. Sikiöissä ei havaita lisääntymiseen liittyviä morfologisia muutoksia siltä osin kuin ne ovat protisteissä.

Aisexual Reproductive Erot

Sikiöiden lisääntyminen tapahtuu sienten kautta hilseilemättömien hedelmöiden aiheuttamien itiöiden kautta tai myseelisen pirstaloitumisen tai orastamisen kautta [9]. Aistillinen reproduktio protisteissä tapahtuu erilaisilla menetelmillä. Binaarinen fissio (yksittäinen ydinosa) ja useat fissiot (useat ydinosaamiset) ovat kaksi Protisteiden keskuudessa yleisiä aiseksuaalisia lisääntymismenetelmiä [8]. Toinen Protisteekohtainen lisääntymisstrategia on Plasmotomy [8]. Plasmotomia esiintyy multinucleated protistien joukossa ja sisältää sytoplasmista jakautumista ilman ydinjakoa [8].

Seksuaaliset lisääntymiserot

Sienet lisääntyvät yleisemmin sikojen mukaan [8,9]. Se on myös monimutkaisempi kuin aeseksuaalinen kopiointi ja vaatii siten yksityiskohtaisempaa kuvausta ymmärtämään, miten prosessi eroaa protisteista ja sieniä.

Sikiön lisääntyminen

Sikiön seksuaalisen lisääntymisen aikana ydinmembraani ja nukleolus (yleensä) pysyvät ennallaan koko prosessin ajan [9]. Plasmogamy, karyogamy ja meioosi koostuvat sienen sukupuolen lisääntymisen kolmesta peräkkäisestä vaiheesta [9]. Plasmogamy tuo protoplasmista fuusiota toisiinsa liittyvien solujen välille, mikä tuo erilliset haploidit ytimet samaan soluun [9]. Näiden haploidien ytimien fuusio ja diploidisen ytimen muodostuminen tapahtuu karyogamyvaiheessa [9]. Karyogamyn loppupuolella on zygotti ja meioosi etenee muodostettaessa karuskuituja ytimessä. Tämä palauttaa haploidisen tilan diploidisen kromosomin erotuksen kautta [9].

Haploidisen ytimen vuorovaikutuksen sienistrategiat seksuaalisen lisääntymisen aikana ovat sikiöissä vaihtelevampia verrattuna protisteihin. Näihin strategioihin kuuluvat gameteiden muodostuminen ja vapautuminen gametangiasta (sukupuolielimet), gametangia-vuorovaikutus kahden organismin ja somaattisen hyphae-vuorovaikutuksen välillä [9].

Protist Seksuaalinen jäljentäminen

Protiseksuaaliset lisääntymisstrategiat ovat melkein täysin erilaisia ​​kuin sienten käyttämät. Nämä strategiat edellyttävät ainutlaatuisia prosesseja, jotka eroavat solurakenteesta johtuen, erityisesti soluista, jotka ovat käytettävissä kosketukseen muiden protisteiden kanssa [8]. Gameteiden muodostuminen ja vapautuminen on seksuaalinen lisääntymismenetelmä erittäin liikkuvien puristettujen protisteiden joukossa [8]. Konjugointi on menetetty protisteiden käyttämä menetelmä, joka edellyttää gametisten ytimien fuusion sijaan itsenäisten sukusolujen muodostumista ja vapautumista [8]. Autogamy, itsestään hedelmöitymisprosessi, jota pidetään edelleen seksuaalisen lisääntymisen muodoksi, tuottaa homotsygoottisuutta itsesuuntautuneen emokennon jälkeläisten joukossa [8].

Yhteenvetotaulukko

Kuten edellä on yhteenveto, protisteja ja sieniä koskevat erot ovat suuria ja niitä voidaan havaita kaikilla rakenteen tasoilla ja kaikissa niiden käyttäytymiseen liittyvissä vuorovaikutuksissa niiden ympäristöjen kanssa. Tämä tarkastelu on vain yhteenveto eroista. Mainitut viitteet kertovat syvällisemmistä selityksistä niille, jotka ovat kiinnostuneita oppimaan enemmän.