Endonukleaasi ja eksonukleaasi
Endonukleaasi vs. eksonukleaasi
Endonukleaasi ja eksonukleaasi ovat nukleaasientsyymit, jotka katalysoivat DNA: n ketjussa läsnä olevien yksittäisten nukleotidien hydrolyysi. Nukleaaseilla on keskeinen rooli nukleotidien sekvenssin analysoinnissa DNA: ssa ja RNA: ssa.
eksonukleaasi Eksonukleaasientsyymit ovat entsyymien luokka, jotka pilkottavat nukleotidit DNA-molekyylin päissä. DNA: n kaksi osaa täydentävät toisiaan. Ne on esitetty 3 ja 5 aseina. DNA: n ja RNA: n fosfodiestersillat hyökkäävät kahdella entsyymiluokalla, jotka on esitetty "a": na ja "b": nä. Ryhmän "a" entsyymit spesifisesti hydrolysoivat esterisidoksen 3 'hiilen ja fosforiryhmän ja entsyymien välillä ryhmän "b" hydrolysoivat esterisidoksen 5 'hiilen ja fosforiryhmän välillä.
Hyvä esimerkki ryhmästä "a" eksonukleaasientsyymi on kouristusten ja Russellin viprin myrkky. Tämä myrkky hydrolysoi kaikki 3'-sidokset DNA: ssa tai RNA: ssa, joka vapauttaa nukleotidiyksiköt nukleosidi 5'-fosfaatteina. Luokan "b" entsyymejä edustaa pernan fosfodiesteraasi, joka hydrolysoi sekä "b": n tai 5 ": n kytkennät sekä DNA: sta että RNA: sta ja vapauttaa siten vain nukleosidi 3'-fosfaatteja. endonukleaasia Endonukleaasientsyymit ovat entsyymejä, jotka pilkottavat DNA: n sidoksia molekyylin sisällä. Ne eivät vaadi vapaata 3 'tai 5'-hydroksyyliryhmää polynukleotidiketjun lopussa. Endonukleaasit hyökkäävät spesifisiä 3'- tai 5'-sidoksia, missä ne esiintyvät polynukleotidiketjussa.
Endonukleaasit luokitellaan myös ryhmiin "a" ja "b". Naudan haiman deoksiribonukleaasi I luokitellaan luokan "a" entsyyminä, joka katalysoi joitain DNA: n 3'-sidosten hydrolyysia, jolloin saadaan oligonukleotideja, jotka sisältävät noin neljää nukleotiditähdettä keskimäärin. Deoksiribonukleaasi II on toinen luokan "b" endonukleaasi. Se eristetään erilaisten bakteerien pernasta ja kateenkorvasta ja aiheuttaa 5'-linkkien hydrolyysin, joka johtaa nukleotidiryhmään. Yhteenveto: 1.Eksonukleaasi aiheuttaa nukleotidin hydrolyysin päissä, joissa polynukleotidiketjussa on läsnä vapaata 3 'tai 5'-hydroksyyliryhmää, kun taas eksonukleaasi ei vaadi vapaata 3'- tai 5'-hydroksyyliryhmää polynukleotidiketjun hydrolyysin aikaansaamiseksi. 2.Eksonukleaasi-aktiivisuus saadaan nukleosideiksi, kun taas endonukleaasiaktiivisuus johtaa oligonukleotideihin. 3. Eksonukleaasin aktiivisuus johtaa polynukleotidiketjun pieniin yksiköihin melkein välittömästi, kun taas endonukleaasiaktiivisuus läpäisee lag-faasin ennen oligonukleotidiryhmien vapauttamista. 4.Snake-myrkky ja pernan fosfodiesteraasi ovat esimerkkejä eksonukleaaseista, kun taas deoksiribonukleaasi I ja II ovat esimerkkejä endonukleaaseista.